辐射避难所作为一款模拟经营类游戏，其通关难度主要体现在游戏机制的无止境挑战特性上。该游戏并未设定传统意义上的通关终点，而是通过资源管理、任务完成度和避难所运营效率来构建动态难度曲线。玩家需要持续平衡电力、食物、水源三大基础资源的生产与消耗，同时应对随机灾难事件和外部入侵威胁。随着避难所人口增长和建筑规模扩大，资源压力会呈指数级上升，若属性分配或房间布局不合理，极易陷入恶性循环。
游戏中的任务系统是衡量阶段性进展的重要标准。教学任务完成后，玩家需逐步达成建造目标、生育人口、探索废土等多样化任务，这些任务的难度会随进度提升而显著增加。例如探索任务后期要求玩家在废土深处对抗高等级敌人，而驻扎任务则需要同时管理多个设施并抵御连续攻击。任务奖励机制鼓励玩家培养高属性居民，但完美培养一个全属性10点的居民需耗费大量时间，这种成长曲线进一步拉长了通关周期。
火灾、蟑螂 infestation 和死爪袭击等突发事件具有连锁反应特性，若未在初始房间及时控制，将逐层蔓延并造成资源链断裂。高层级避难所面临的辐射蟑螂拥有极高生命值，需要配置满级居民与传奇武器才能有效应对。游戏采用动态难度调节机制，居民平均等级越高，入侵敌人的强度也会同步提升，这种设计迫使玩家必须均衡发展而非单纯追求等级压制。
